Lupin III (Oguri Shun), Daisuke Jigen (Tamayama Tetsuji), Ishikawa Goemon (Ayano Go), Fujiko Mine (Kuroki Meisa) y el inspector Koichi Zenigata (Asano Tadanobu) se reúnen. Se enfrentan a un poderoso enemigo y forman el equipo de Lupin como respuesta. El equipo de Lupin se enfrenta al reto de recuperar el "Corazón Carmesí de Cleopatra" encerrado en una fortaleza de seguridad llamada el "Arca de Navarone." Se piensa que el tesoro permite a su dueño controlar el mundo.